Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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SHROOM2Q13796 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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SHROOM2Q13796 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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SHROOM2Q13796 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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SHROOM2Q13796 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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SHROOM2Q13796 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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SHROOM2Q13796 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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