Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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