Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms