Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 RN7SL519P-201ENST00000497925 288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 TMEM92-AS1-201ENST00000508851 750 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AC005225.3-201ENST00000555972 519 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms