Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 GPR15-201ENST00000284311 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 FAM122C-202ENST00000370785 1344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 TGIF1-203ENST00000345133 1088 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL359918.2-201ENST00000412311 497 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 LAMTOR5-AS1-202ENST00000457535 817 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 LINC02251-201ENST00000554798 1224 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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