Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms