Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms