Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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FOXF2Q12947 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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