Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms