Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ID3Q02535 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ID3Q02535 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ID3Q02535 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ID3Q02535 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ID3Q02535 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ID3Q02535 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ID3Q02535 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ID3Q02535 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ID3Q02535 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
ID3Q02535 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ID3Q02535 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ID3Q02535 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ID3Q02535 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ID3Q02535 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms