Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHDQ02161 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHDQ02161 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms