Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms