Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SKOR1P84550 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms