Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAP25P60880 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAP25P60880 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms