Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms