Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUFMP49411 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms