Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNI2P48788 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNI2P48788 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms