Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms