Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms