Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH5P33151 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH5P33151 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH5P33151 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH5P33151 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH5P33151 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH5P33151 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH5P33151 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH5P33151 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH5P33151 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH5P33151 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH5P33151 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH5P33151 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH5P33151 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH5P33151 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH5P33151 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH5P33151 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms