Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KB1P23443 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms