Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RHOP08100 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RHOP08100 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RHOP08100 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RHOP08100 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RHOP08100 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOP08100 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOP08100 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOP08100 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOP08100 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOP08100 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOP08100 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOP08100 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOP08100 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOP08100 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOP08100 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOP08100 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RHOP08100 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms