Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MAP3K4Q9Y6R4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MAP3K4Q9Y6R4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
MAP3K4Q9Y6R4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms