Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC1Q9Y5R8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms