Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms