Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
POMPQ9Y244 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms