Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPS5Q9UPZ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPS5Q9UPZ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms