Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.82■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDZRN3Q9UPQ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms