Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC4EQ9ULY5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLEC4EQ9ULY5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms