Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA2Q9UL42 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA2Q9UL42 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms