Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPN3Q9UHW5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPN3Q9UHW5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPN3Q9UHW5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms