Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPS1Q9UHF7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms