Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SWAP70Q9UH65 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SWAP70Q9UH65 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms