Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGXB4Q9UGU5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGXB4Q9UGU5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms