Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK4Q9UBT3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms