Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAE1Q9UBE0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAE1Q9UBE0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms