Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDH10Q9P2E7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms