Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN3Q9P232 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN3Q9P232 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN3Q9P232 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN3Q9P232 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN3Q9P232 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms