Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFAF4Q9P032 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFAF4Q9P032 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NDUFAF4Q9P032 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFAF4Q9P032 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFAF4Q9P032 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFAF4Q9P032 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFAF4Q9P032 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms