Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ43

USE1, Vesicle transport protein USE1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1Q9NZ43 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USE1Q9NZ43 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USE1Q9NZ43 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USE1Q9NZ43 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USE1Q9NZ43 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USE1Q9NZ43 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USE1Q9NZ43 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USE1Q9NZ43 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USE1Q9NZ43 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USE1Q9NZ43 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USE1Q9NZ43 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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