Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM28Q9NW13 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM28Q9NW13 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM28Q9NW13 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms