Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT82Q9NSB4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT82Q9NSB4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms