Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHPT1Q9NRX4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms