Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6BQ9NRW1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms