Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH12Q9NPG4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms