Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TUFT1Q9NNX1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUFT1Q9NNX1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms