Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH9

MKNK2, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK2Q9HBH9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKNK2Q9HBH9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKNK2Q9HBH9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKNK2Q9HBH9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKNK2Q9HBH9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKNK2Q9HBH9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKNK2Q9HBH9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKNK2Q9HBH9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKNK2Q9HBH9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKNK2Q9HBH9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKNK2Q9HBH9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKNK2Q9HBH9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
MKNK2Q9HBH9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKNK2Q9HBH9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms