Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD3Q9H7B4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD3Q9H7B4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms