Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCL3Q9H2J4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCL3Q9H2J4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms