Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDGFDQ9GZP0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PDGFDQ9GZP0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDGFDQ9GZP0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms